Известия Саратовского университета. Новая серия.

Серия Химия. Биология. Экология

ISSN 1816-9775 (Print)
ISSN 2541-8971 (Online)


Для цитирования:

Панкратов А. Н., Цивилева О. М., Древко Б. И., Никитина В. Е. КВАНТОВОХИМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ И QSAR-СВОЙСТВА АРОМАТИЧЕСКИХ ПРОИЗВОДНЫХ З-СЕЛЕНПЕНТАН-ДИОНА-1,5: ПРЕДПОСЫЛКИ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ С УГЛЕВОДСВЯЗЫВАЮЩИМИ БЕЛКАМИ // Известия Саратовского университета. Новая серия. Серия: Химия. Биология. Экология. 2010. Т. 10, вып. 1. С. 7-13. DOI: 10.18500/1816-9775-2010-10-1-7-13

Статья опубликована на условиях лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International (CC-BY 4.0).
Полный текст в формате PDF(Ru):
(загрузок: 43)
Язык публикации: 
русский
Рубрика: 
Тип статьи: 
Научная статья
УДК: 
582.28:57.083

КВАНТОВОХИМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ И QSAR-СВОЙСТВА АРОМАТИЧЕСКИХ ПРОИЗВОДНЫХ З-СЕЛЕНПЕНТАН-ДИОНА-1,5: ПРЕДПОСЫЛКИ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ С УГЛЕВОДСВЯЗЫВАЮЩИМИ БЕЛКАМИ

Авторы: 
Панкратов Алексей Николаевич, Саратовский национальный исследовательский государственный университет имени Н. Г. Чернышевского
Цивилева Ольга Михайловна, Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов РАН
Древко Борис Иванович, Саратовский государственный аграрный университет им. В.И. Вавилова.
Никитина Валентина Евгеньевна, Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов РАН
Аннотация: 

Выяснена роль пространственной и электронной структуры, гидрофобных  свойств и концентрации селенорганических  соеди­нений при их  взаимодействии с  грибными метаболитами, угле- водсвязывающими белками - внеклеточными лектинами высшего гриба шиитаке. Гибридным методом теории функционала плот­ ности на уровне теории B3LYP/6-31 G(d,p) изучена пространст­ венная и электронная структура молекул 1,5-ди(4-Р-фенил)-3- селенпентандионов-1,5. Посредством оценки QSAR-свойств по атомно-связево-аддитивным схемам показаны различия в гид­ рофобности указанных  соединений. Полученные теоретические характеристики использованы при интерпретации эксперимен­ тальных  данных  об увеличении активности лектинов шиитаке в присутствии 1,5-ди(4-П-фенил)-3-селенпентандионов-1,5 и наи­ более высокой эффективности этокси-производного.

Список источников: 

1. 

Whanger P.D. Selenocompounds in Plants and Animals and Their Biological Significance // J. Amer. Coll. Nutr. 2002, Vol.21, №3.P.223-232.

2. 

Mikiashvili N.Elisashvili V., Wasset- S.P., Nevo E. Comparative Study of Lectin Activity of Higher Basidiomycetes // Int. J. Med. Mushrooms. 2006. Vol.8, Iss.l. P.31-38.  EDN: MHAKKP

3. 

Яуцик М.Д.Панамок Е.К, Луцик А.Д. Лектины. Львов, 1981. 156 с.

4. 

Цивилева О.М.Никитина В.Е.Лощинина Е.А. Выделение и характеристика внеклеточных лектинов Lentinus edodes (Berk.) Sing // Биохимия. 2008. T.73, №10. С.1438-1446.  EDN: JUUYOR

5. 

Цивилева О.М, Никитина В. Е.Панкратов А.Я, Древко Б.И.Лощинина Е.А.Гарыбова Л.В. Влияние селенсо-держащего препарата ДАФС-25 на рост и лектиновую активность Lentinus edodes i/ Биотехнология. 2005. №2. С.56-62.  EDN: HVTSAT

6. 

Кон В. Электронная структура вещества - волновые функции и функционалы плотности // УФН. 2002, Т. 172, №3. С.336-348.

7. 

Becke A.D. Density-Functional Exchange-Energy Approximation with Correct Asymptotic Behavior // Physical Review A. 1988. Vol.38, №6. P.3098-3100.  EDN: SMQBQL

8. 

Becke А.D. Density-Functional Thermochemistry. III. The Role of Exact Exchange // J. Chem. Phys. 1993. Vol.98, №7. P.5648-5652.  EDN: SGUIWZ

9. 

Lee C, Yang W, Parr R.G. Development of the Colle-Salvetti Correlation-Energy Formula into a Functional of the Electron Density // Physical Review B. 1988. Vol.37, №2. P.785-789.

10. 

Ditchfield R., Hehre WJ., Popte J.A. A Self-Consistent Molecular-Orbital Methods. ГХ. An Extended Gaussian-Type Basis for Molecular-Orbital Studies of Organic Molecules // J. Chem. Phys. 1971. Vol.54, №2. P.724-728.

11. 

Blessing H.Kraus S.Heindl P.Bal W.Hartwig A. Interaction of selenium compounds with zinc finger proteins involved in DNA repair // Eur. J. Biochem. 2004. Vol.271, №15. P.3190-3199.  EDN: MGJYRL

12. 

Jacob C, Maret W., Vallee B.L. Selenium redox biochemistry of zinc-sulfur coordination sites in proteins and enzymes // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1999. Vol.96, №5. P.1910-1914.

13. 

Turan В.Eliss H.Desilets M. Oxidants increase the intracellular free Zn2 concentration in rabbit ventricular myocytes // Amer. J. Physiol. 1997. Vol.272, №5 (Pt.2). P.2095-2106.

14. 

Ganther H.E. Selenium metabolism, selenoproteins and mechanisms of cancer prevention: complexities with thiore-doxin reductase // Carcinogenesis. 1999. Vol.20, №9. P.1657-1666.  EDN: IMVBLV

15. 

Jacob C, Giles G.I., Giles N.M., Sies H. Sulfur and selenium: the role of oxidation state in protein structure and function // Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 2003. Vol.42, №39. P.4742-4758.

16. 

Лахтин В.М. Биотехнология лектинов // Биотехнология. 1989. T.5, №6. C.676-691.  EDN: IEXDQO

17. 

Лахтин В.М. Молекулярная организация лектинов // Молекулярная биология. 1994. Т.28, вып.2. С.245-273.  EDN: NFBRGS

18. 

Elgavish S.Shaanan В. Eectin-Carbohydrate Interactions: Different Folds, Common Recognition Principles // Trends Biochem. Sci. 1997. Vol.22, №12. P.462-467.  EDN: AKOHSZ

19. 

Hasel W.Hendrickson Т.Е.Still W.C. A Rapid Approximation to the Solvent-Accessible Surface Areas of Atoms // Tetrahedron Computer Methodology. 1988. Vol.1, №2. P.103-116.

20. 

Still W.C.Tempczyk A., Haw ley R.C., Hendrickson Th, Semianalytical Treatment of Solvation for Molecular Mechanics and Dynamics // J. Amer. Chem. Soc. 1990. Vol.112, №16. P.6127-6129.

21. 

Bodor N.Gabanyi Z., Wong Chu-Kuok. A New Method for the Estimation of Partition Coefficient // J. Amer. Chem. Soc. 1989. Vol.111, №11. P.3783-3786.

22. 

Gavezotti A. The Calculation of Molecular Volumes and the Use of Volume Analysis in the Investigation of Structured Media and of Solid-State Organic Reactivity // J. Amer. Chem. Soc. 1983. Vol.105, №16. P.5220-5225.

23. 

Ghose A.K.Crippen G.M. Atomic Physicochemical Parameters for Three-Dimensional Structure-Directed Quantitative Structure - Activity Relationships. I. Partition Coefficients As a Measure of Hydrophobicity // J. Comput. Chem. 1986. Vol.7,№4.P.565-577.

24. 

Ghose A.K.Crippen G.M. Atomic Physicochemical Parameters for Three-Dimensional-Structure-Directed Quantitative Structure - Activity Relationships. 2. Modelling Disperse and Hydrophobic Interactions // J. Chem. Inf. and Comput. Sci. 1987. Vol.27, №1.P.21-35.

25. 

Viswanadhan V.N.Ghose A.K.Revankar G.N.Robins R.K. Atomic Physicochemical Parameters for Three Dimensional Structure Directed Quantitative Structure - Activity Relationships. 4. Additional Parameters for Hydrophobic and Dispersive Interactions and Their Application for an Automated Superposition of Certain Naturally Occurring Nucleoside Antibiotics // J. Chem. Inf. and Comput. Sci. 1989. Vol.29, №3. P.163-172.

26. 

Miller K.J. Additivity Methods in Molecular Polarisability //J. Amer. Chem. Soc. 1990. Vol.112, №23. P.8533-8542.

27. 

Ghose A.K.Pritchett A.Crippen G.M. Atomic Physico-chemical Parameters for Three Dimensional Structure Directed Quantitative Structure - Activity Relationships III. Modelling Hydrophobic Interactions // J. Comput. Chem. 1988. Vol.99, №l.P.80-90.

Поступила в редакцию: 
02.11.2009
Принята к публикации: 
10.01.2010
Опубликована: 
25.02.2010
Краткое содержание:
(загрузок: 33)