Известия Саратовского университета. Новая серия.

Серия Химия. Биология. Экология

ISSN 1816-9775 (Print)
ISSN 2541-8971 (Online)

Для цитирования:

Шаравин Д. Ю., Соломенный А. П. Консервативные и вариабельные участки гена метанолдегидрогеназы у галотолерантных представителей рода Methylophaga // Известия Саратовского университета. Новая серия. Серия: Химия. Биология. Экология. 2017. Т. 17, вып. 4. С. 452-457. DOI: 10.18500/1816-9775-2017-17-4-452-457

Статья опубликована на условиях лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International (CC-BY 4.0).
Полный текст в формате PDF(Ru):
скачать
(загрузок: 97)
Язык публикации: 
русский
Рубрика: 
Биология
Тип статьи: 
Научная статья
УДК: 
579.64: 579.84
DOI: 
10.18500/1816-9775-2017-17-4-452-457

Консервативные и вариабельные участки гена метанолдегидрогеназы у галотолерантных представителей рода Methylophaga

Авторы: 
Шаравин Дмитрий Юрьевич, Институт экологии и генетики микроорганизмов Уральского отделения РАН
Соломенный Александр Петрович, Институт экологии и генетики микроорганизмов Уральского отделения РАН
Аннотация: 

В работе изучены консервативные и вариабельные участки в структуре гена mxaF и транслированной аминокислотной последовательности у выделенного из микробно-растительной ассоциации галотолерантного метилотрофного изолята М1К, отнесённого к роду Methylophaga. В ходе проведённого исследова- ния с использованием метода минимума эволюции обнаружена гетерогенность mxaF среди исследованных родов метило- и ме- танотрофов. Высокая солеустойчивость и зафиксированная спо- собность синтезировать ауксин из L-триптофана делает штамм М1К перспективным для использования в агротехнологии.

Ключевые слова: 
галотолерантность
метилотрофы
метанотрофы
фитосимбиоз
микроэволюция
Список источников: 
  1. Kutschera U. Plant-associated methylobacteria as coevolved phytosymbionts // Plant Signaling & Behavior. 2007. Vol. 2. P. 74–78.
  2. Фёдоров Д. Н., Доронина Н. В., Троценко Ю. А. Фитосимбиоз аэробных метилобактерий : новые факты и гипотезы // Микробиология. 2011. Т. 80, № 4. С. 435–446.
  3. Троценко Ю. А., Доронина Н. В., Торгонская М. Л. Аэробные метилобактерии. Пущино : ОНТИ ПНЦ РАН, 2010. 325 с.
  4. Lau E., Fisher M. C., Steudler P. A., Cavanaugh C. M. The methanol dehydrogenase gene mxaF, as a functional phylogenetic marker for proteobacterial methanotrophs in natural environments // PLOS ONE. 2013. Vol. 8. P. e56993.
  5. Janvier M., Frehel C., Grimont F., Gasser F. Methylophaga marina gen. nov., sp. nov. and Methylophaga thalassica sp. nov., marine methylotrophs // Intern. J. Syst. Bacteriol. 1985. Vol. 35. P. 131–139.
  6. Villeneuve C., Martineau C., Maufferey F., Villemur R. Methylophaga nitratireducenticrescens sp. nov. and Methylophaga frappieri sp. nov., isolated from the bio? lm of the methanol-fed denitri? cation system treating the seawater at the Montreal Biodome // Intern. J. Syst. Evol. Micr. 2013. Vol. 63. P. 2216–2222.
  7. Gordon S. A., Weber R. P. Colorimetric estimation of indole-acetic acid // Plant Physiol. 1951. Vol. 26. P. 192–195.
  8. Lane D. J. 16S/23S rRNA sequencing // Nucleic acid techniques in bacterial systematic / eds. E. Stackebrandt, M. Goodfellow. N.Y. : Academic Press, 1991. P. 115–167.
  9. Gogleva A. A., Kaparullina E. N., Doronina N. V., Trotsenko Y. A. Methylobacillus arboreus sp.nov. and Methylobacillus gramineus sp.nov., novel nonpigmented obligate methylotrophic bacteria associated with plants // Syst. Appl. Microbiol. 2011. Vol. 34. P. 477–481.
  10. Doronina N. V., Darmaeva T. D., Trotsenko Y. A. Methylophaga alcalica sp. nov., a novel alkaliphilic and moderately halophilic, obligately methylotrophic bacterium from an East Mongolian saline soda lake // Intern. J. Syst. Evol. Micr. 2003. Vol. 53. P. 223–229.
  11. Kim H. G., Doronina N. V., Trotsenko Y. A., Kim S. W. Methylophaga aminisulfidivorans sp. nov., a restricted facultatively methylotrophic marine bacterium // Intern. J. Syst. Evol. Micr. 2007. Vol. 57. P. 2096– 2101.
  12. Antony C. P., Doronina N. V., Boden R., Trotsenko Y. A., Shouche Y. S., Murrell J. C. Methylophaga lonarensis sp. nov., a moderately haloalkaliphilic methylotroph isolated from the soda lake sediments of a meteorite impact crater // Intern. J. Syst. Evol. Micr. 2012. Vol. 62. P. 1613– 1618.
  13. Доронина Н. В., Ли Ц. Д., Иванова Е. Г., Троценко Ю. А. Methylophaga murata sp. nov. – галоалкалофильный аэробный метилотроф из разрушающегося мрамора // Микробиология. 2005. Т. 74, № 4. С. 511–519. 
  14. 14. Jeong J. H., Kim S. W., Yoon S. M., Park J. K., Lee J. S. Characterization of the conserved region of the mxaF gene that encodes the large subunit of the methanol dehydrogenase from a marine methylotrophic bacterium // Mol. Cells. 2002. Vol. 13, № 3. P. 369–376.
  15. Graziano G., Merlino A. Molecular bases of protein halotolerance // Biochim. et Biophys. Acta. 2014. Vol. 1844, № 4. P. 850–858.