Для цитирования:
Федоненко Ю. П., Чернышова М. П., Гринёв В. С., Коннова С. А., Игнатов В. В. ХАРАКТЕРИСТИКА СОСТАВА ЛИПОПОЛИСАХАРИДА ГАЛОТОЛЕРАНТНЫХ БАКТЕРИЙ AZOSPIRILLUM HALOPRAEFERENS Au4 // Известия Саратовского университета. Новая серия. Серия: Химия. Биология. Экология. 2014. Т. 14, вып. 3. С. 88-94. DOI: 10.18500/1816-9775-2014-14-3-88-94
Статья опубликована на условиях лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International (CC-BY 4.0).
Полный текст в формате PDF(Ru):
(загрузок: 120)
Язык публикации:
русский
Рубрика:
Тип статьи:
Научная статья
УДК:
579.234
ХАРАКТЕРИСТИКА СОСТАВА ЛИПОПОЛИСАХАРИДА ГАЛОТОЛЕРАНТНЫХ БАКТЕРИЙ AZOSPIRILLUM HALOPRAEFERENS Au4
Авторы:
Федоненко Юлия Петровна, Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов РАН
Чернышова Мария Павловна, Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов РАН
Гринёв Вячеслав Сергеевич, Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов РАН
Коннова Светлана Анатольевна, Саратовский национальный исследовательский государственный университет имени Н. Г. Чернышевского
Игнатов Владимир Владимирович, Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов РАН
Аннотация:
Проведено исследование состава липополисахарида почвен-
ных галотолерантных бактерий Azospirillum halopraeferens Au4.
Выявлена более высокая электрофоретическая подвижность
S-форм ЛПС A. halopraeferens Au4 в полиакриламидном геле,
по сравнению с типовым штаммом A. brasilense Sp7. Установ-
лено, что состав ЖК ЛПС штамма Au4 незначительно отличал-
ся от ЛПС большинства изученных штаммов A. brasilense и
A. lipoferum. В коровой области ЛПС отмечено преобладание
глюкозы. С использованием методов иммунохимии и структур-
ного анализа показано, что ОПС A. halopraeferens Au4 характе-
ризуется уникальной структурой повторяющихся звеньев, не
встречавшейся ранее у других штаммов азоспирилл. В составе
ОПС обнаружены метилированная 6-дезоксигексоза, L-рамноза,
D-фукоза, D-ксилоза и D-глюкоза.
Ключевые слова:
Список источников:
1. Bhattacharyya P. N., Jha D. K. Plant growth-promoting
rhizobacteria (PGPR) : emergence in agriculture // World
J. Microb. Biot. 2012. Vol. 28. P. 1327–1350.
2. Lugtenberg B., Kamilova F. Plant-growth-promoting
rhizobacteria // Annu. Rev. Microbiol. 2009. Vol. 63.
P. 541–556.
3. Skvortsov I. M., Ignatov V. V. Extracellular polysaccharides
and polysaccharide-containing biopolymers from
Azospirillum species : properties and the possible role
in interaction with plant roots // FEMS Microbiol. Lett.
1998. Vol. 165. P. 223–229.
4. Evseeva N. V., Matora L. Y., Burygin G. L., Dmitrienko
V. V., Shchyogolev S. Y. Effect of Azospirillum brasilense
Sp245 lipopolysaccharide on the functional activity
of wheat root meristematic cells // Plant Soil. 2011.
Vol. 346. P. 181–188.
5. Konnova S. A., Makarov O. E., Skvortsov I. M., Ignatov
V. V. Isolation, fractionation and some properties
of polysaccharides produced in a bound form by Azospirillum
brasilense and their possible involvement in
Azospirillum – wheat root interaction // FEMS Microbiol.
Lett. 1994. Vol. 118. P. 93–99.
6. Коннова С. А., Брыкова О. С., Сачкова О. А.,
Егоренкова И. В., Игнатов В. В. Исследование
защитной роли полисахаридных компонентов кап-
сулы бактерий Azospirillum brasilense // Микро био-
логия. 2001. Т. 70. С. 503–508.
7. Kefalogianni I., Aggelis G. Modeling growth and biochemical
activities of Azospirillum spp. // Appl. Microbiol.
Biot. 2002. Vol. 58. P. 352–357.
8. Boyko A. S., Konnova S. A., Fedonenko Y. P., Zdorovenko
E. L., Smol’kina O. N., Kachala V. V., Ignatov V. V.
Structural and functional peculiarities of the lipopolysaccharide
of Azospirillum brasilense SR55, isolated from
the roots of Triticum durum // Microbiol. Res. 2011.
Vol. 166. P. 585–593.
9. Fedonenko Y. P., Konnova O. N., Zatonsky G. V., Shashkov
A. S., Konnova S. A., Zdorovenko E. L., Ignatov V. V.,
Knirel Y. A. Structure of the O-polysaccharide of the
lipopolysaccharide of Azospirillum irakense KBC1 //
Carbohydr. Res. 2004. Vol. 339. P. 1813–1816.
10. Бойко А. С., Смолькина О. Н., Федоненко Ю. П.,
Здоровенко Э. Л., Качала В. В., Коннова С. А., Игна-
тов В. В. Особенности структуры О-полисахаридов
азоспирилл серогруппы I // Микробиология. 2010.
Т. 79, № 2. С. 219–227.
11. Федоненко Ю. П., Бойко А. С., Здоровенко Э. Л., Конно-
ва С. А., Шашков А. С., Игнатов В. В., Книрель Ю. А.
Структурные особенности О-специфических по-
лисахаридов бактерий Azospirillum серогруппы III //
Биохимия. 2011. Т. 76, № 7. С. 976–982.
12. Reinhold B., Hurek T., Fendrik I., Pot B., Gillis M.,
Kersters K., Thielemans S., De Ley J. Azospirillum
halopraeferens sp. nov., a nitrogen-fi xing organism associated
with roots of kallar grass (Leptochloa fusca (L.)
Kunth) // Inter. J. Syst. Bacteriol. 1987. Vol. 37. P. 43–51.
13. Dodd I. C.., Perez-Alfocea F. Microbial amelioration
of crop salinity stress // J. Exp. Bot. 2012. Vol. 63.
P. 3415–3428.
14. Mendes R., Garbeva P, Raaijmakers J. M. The rhizosphere
microbiome : signifi cance of plant-benefi cial,
plant-pathogenic and human-pathogenic microorganisms
// FEMS Microbiol. Rev. 2013. Vol. 37. P.634–663
15. Кульшин В. А., Яковлев А. П., Аваева С. Н., Дмитри-
ев Б. А. Улучшенный метод выделения липополи-
сахаридов из грамотрицательных бактерий // Мол.
генетика, микробиол. и вирусол. 1987. № 5. C. 44–46.
16. Hitchcock P. J., Brown T. M. Morphological heterogeneity
among Salmonella lipopolysaccharide chemotypes
in silver-stain polyacrylamide gels // J. Bacteriol. 1983.
Vol. 154. P. 269–277.
17. Tsai C. M., Frasch C. E. A sensitive silver stain for
detecting lipopolysaccharides in polyacrylamide gels //
Anal. Biochem. 1982. Vol. 119. P. 115–119.
18. Mayer H., Tharanathan R. N., Weckesser J. Analysis of
lipopolysaccharides of Gram-negative bacteria // Methods
Microbiol. 1985. Vol. 18. P. 157–207.
19. Sawardecker J. S., Sloneker J. H., Jeans A. Quantitative
determination of monosaccharides as their alditol acetates
by gas liquid chromatography // Anal. Chem. 1965.
Vol. 37. P. 1602–1603.
20. Leontein K., Lindberg B., Lonngren J. Assignment of absolute
confi guration of sugars by g.l.c. of their acetylated
glycosides formed from chiral alcohols // Carbohydr. Res.
1978. Vol. 62. P. 359–362.
21. Komaniecka I., Zdzisinska B., Kandefer-Szerszen M.,
Choma A. Low endotoxic activity of lipopolysaccharides
isolated from Bradyrhizobium, Mesorhizobium,
and Azospirillum strains // Microbiol. Immunol. 2010.
Vol. 54. P. 717–725.
22. Суркина А. К., Коннова С. А., Федоненко Ю. П., Игна-
тов В. В. Гликополимеры бактерий рода Azospirillum
как перспективные антагонисты классических эндо-
токсинов // Изв. Сарат. ун-та. Нов. сер. Сер. Химия.
Биология. Экология. 2013. Т. 13, вып. 2. С. 78–85.
23. Игнатов В. В., Коннова О. Н., Бойко А. С., Фоми-
на А. А., Федоненко Ю. П., Коннова С. А. Характери-
стика состава жирных кислот липидов А липополи-
сахаридов бактерий рода Azospirillum // Изв. Сарат.
ун-та. Нов. сер. Сер. Химия. Биология. Экология.
2009. Т. 9, вып. 1. С. 36–41.
24. Choma A., Komaniecka I. Characterization of a novel
lipid A structure isolated from Azospirillum lipoferum
lipopolysaccharide // Carbohydr. Res. 2008. Vol. 343.
P. 799–804.
25. Lerouge I., Vanderleyden J. O-antigen structural variation:
mechanisms and possible roles in animal/plantmicrobe
interactions // FEMS Microbiol. Rev. 2002.
Vol. 26. P. 17–47.
26. Коннова О. Н., Бойко А. С., Бурыгин Г. Л., Федонен-
ко Ю. П., Матора Л. Ю., Коннова С. А., Игна-
тов В. В. Химические и серологические исследования
бактерий рода Azospirillum // Микробиология. 2008.
Т. 77, № 3. С. 350–357.
27. Kannenberg E. L., Carlson R. W. Lipid A and O-chain
modifi cations cause Rhizobium lipopolysaccharides to
become hydrophobic during bacteroid development //
Mol. Microbiol. 2001. Vol. 39. P. 379–391.
28. Boyko A. S., Dmitrenok A. S., Fedonenko Yu. P.,
Zdo rovenko E. L., Konnova S. A., Knirel Y. A., Ignatov
V. V. Structural analysis of the O-polysaccharide from
Azospirillum brasilense Jm6B2 containing 3-O-methyl-
D-rhamnose (D-acofriose) // Carbohydr. Res. 2012.
Vol. 355. P. 92–95.
29. Sigida E. N., Fedonenko Y. P., Zdorovenko E. L., Konnova
S. A., Shashkov A. S., Ignatov V. V., Knirel Y. A.
Structure of repeating units of a polysaccharide(s)
from the lipopolysaccharide of Azospirillum brasilense
SR80 // Carbohydr. Res. 2013. Vol. 371. P. 40?44.
30. Sigida E. N., Fedonenko Yu. P., Shashkov A. S., Zdorovenko
E. L., Konnova S. A., Ignatov V. V., Knirel Y. A.
Structural studies of the O-specifi c polysaccharide(s)
from the lipopolysaccharide of Azospirillum brasilense
type strain Sp7 // Carbohydr. Res. 2013. Vol. 380.
P. 76?80.